一、生存环境
从生存环境来说，黑枸杞多分布在高山沙林、盐化沙地、荒漠河岸中，生长在人类几乎无法生存的荒山野岭，生长条件十分艰苦，是纯野生、无污染的，产量稀少，十分珍贵；而红枸杞已经可以人工大量种植。
二、价格方面
黑枸杞的价格从几百元到几千元一斤不等，同时存在造假的可能。而红枸杞分为宁夏枸杞、土枸杞、津血杞等，不同产地和品种，价格也不同。同时红枸杞还分为不同的级别，价格也更有差异。
三、外观方面
黑枸杞和红枸杞除了明显的颜色不同外，还有，黑枸杞因为是野生的，颗粒小，扁圆形的黑色果实；而红枸杞外观上则是扁长型的红色果实。
四、泡水颜色
红枸杞泡水的颜色是淡黄色。黑枸杞泡水的颜色是梦幻紫、醉心蓝。因为黑枸杞中的花青素是一种水溶性色素，而且对酸碱性特别敏感，在自来水中泡出来是蓝色，在纯净水中泡出来是紫色。
五、功效方面
黑枸杞主要是有很高的花青素，有抗氧化的功效，主要有着抗衰老和美白的作用。而红枸杞不含花青素，它的主要功效是益精、养肝明目、补血安神等。他们在功效上是完全不一样的。
六、吃法用量
黑枸杞含有丰富的花青素，故对泡水温度有一定的要求，要用60℃以下的温水或冷水冲泡。因为花青素高温下易被破坏，所以不能长时间高温熬煮。黑枸杞的滋补性很强，成人一天食用5g左右即可。红枸杞则不怕高温，可以直接嚼食、泡水、泡酒、熬汤等，成人一天食用20g左右为佳。
